Бесплатный инструмент
NGS Sample Sheet Validator
Проверьте таблицу образцов, пары FASTQ, условия и реплики.
Получите нормализованный samples.tsv и минимальные конфиги
для Snakemake и Nextflow.
Таблица обрабатывается в памяти и не сохраняется. FASTQ-файлы загружать не нужно.
Исходная таблица
Обязательные колонки: sample, condition,
fq1, fq2. Необязательная:
replicate. Разделитель определяется автоматически.
Формат таблицы
sample condition fq1 fq2
control_1 control data/control_1_R1.fastq.gz data/control_1_R2.fastq.gz
control_2 control data/control_2_R1.fastq.gz data/control_2_R2.fastq.gz
stress_1 stress data/stress_1_R1.fastq.gz data/stress_1_R2.fastq.gz
stress_2 stress data/stress_2_R1.fastq.gz data/stress_2_R2.fastq.gz
Также распознаются распространённые имена колонок:
sample_id, group, fastq_1,
fastq_2, r1 и r2.